Forskjellen mellom Gene Knockout og Knockdown
Share
De nøkkelforskjell mellom gen knockout og knockdown er at genknockout er en teknikk hvor genet av interesse er helt fjernet (inoperativ tilstand) å studere av genets funksjoner mens genknockdown er en annen teknikk hvor genet av interesse er stilket å undersøke rollen til det bestemte genet i et biologisk system.
Ulike genetiske teknikker er i drift for å undersøke generens funksjon i de levende biologiske systemene. Gene knockout og knockdown er to slike teknikker. Disse teknikkene hjelper forskere til å identifisere funksjonelle aspekter av forskjellige gener i levende organismer.
INNHOLD
1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er Gene Knockout
3. Hva er Gene Knockdown
4. Likheter mellom Gene Knockout og Knockdown
5. Side ved side-sammenligning - Gene Knockout vs Knockdown i tabellform
6. Sammendrag
Hva er Gene Knockout?
Gene knockout er en genetisk teknikk som gjør en eller flere gener utilvirkende i levende organismer. Dette er også en prosess for å slå av eller slette et gen av en organisme. Den primære anvendelsen av denne teknikken er å studere genfunksjonen. Prosessen evaluerer effekten av det tapt eller fjernet genet. Knockout-prosessen innebærer også visse enzymer og spleising teknikker.
Figur 01: Gene Knockout
Det er få variasjoner i genknockout-teknikken basert på antall involverte gener. De er dobbel knockout (knockout av to gener), trippel knockout (knockout av tre gener) og firedoble knockout (knockout av fire gener). Gene knockout er videre klassifisert i to grupper; heterozygote knockouts og homozygote knockouts.
Hva er Gene Knockdown?
Gene knockdown er en eksperimentell prosedyre der denne prosedyren undertrykker eller reduserer uttrykket av et bestemt gen eller gener av en organisme. Gene silencing er den vanlige definisjonen for genknockdown. Under denne prosedyren involverer aktiveringen eller nedbrytningen av det produserte mRNA RNA-interferens (RNAi), lite interfererende RNA (siRNA) og kort hårnål RNA (shRNA).
Figur 02: Gene Silencing
Den primære bruken av genknockdown er å undersøke rollen til det bestemte genet i det biologiske systemet. Derfor utfører denne teknikken studien av onkogener (Bcl-2 og P53) og gener som forårsaker nevrologiske sykdommer, virusinfeksjoner og arvelige sykdommer.
Hva er likhetene mellom Gene Knockout og Knockdown?
- Både genknockout og genknockdown er genetiske teknikker.
- Disse to teknikkene kan forhindre genuttrykk.
- Den primære bruken av begge teknikkene er å undersøke funksjonen av genet av interesse.
- Begge er i stand til å identifisere forskjellige sykdomstilstander (genetisk).
- De begge kunne brukes for en eller flere gener av interesse.
Hva er forskjellen mellom Gene Knockout og Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown | |
| Gene knockout er i drift av gener (fjerning av gener fra DNA) av en organisme gjennom forskjellige genetiske teknikker. | Gene knockdown er en eksperimentell prosedyre for å undertrykke (redusere eller stille) uttrykket av et bestemt gen eller gener av en organisme. |
| Funksjon | |
| Tilrettelegger studien av generfunksjoner ved å analysere resultatene av det tapte genet. | Tilrettelegger studiet av onkogener, gener som forårsaker nevrologiske sykdommer, virusinfeksjoner og arvelige sykdommer. |
| Engasjement av RNA-agenter | |
| Innblanding av RNA-midler er ubetydelig i denne teknikken. | Prosessen involverer midlene som siRNA, shRNA og RNAi for å inaktivere mRNA. |
| Bruk av kjemiske agenter | |
| Enzymatiske midler brukes. | Ingen slike kjemiske midler brukes. |
| Effekt på gen | |
| Fjerner genet helt fra DNA. | Undertrykke eller tause genet. |
| Klassifisering | |
| Double knockout, triple knockout og quadruple knockout og heterozygous og homozygot knockout er forskjellige typer gen knockout. | Ingen slike klassifiseringssystemer tilgjengelig for genstansing. |
Sammendrag - Gene Knockout vs Gene Knockdown
De to teknikkene vi diskuterte her; Gen-knockout og knockdown, er metoder for å undersøke funksjonene til forskjellige gener. Gene knockout gjør genetet uvirksomt, mens genknockdown tynger genet av interesse. Begge prosedyrene forhindrer imidlertid genuttrykket. Ulike agenter er i stand til å oppnå disse to prosessene. Gene knock out er en type sletting mens genknockdown er en type inaktivering. Dette er forskjellen mellom gen-knock-out og knockdown.
Henvisning:
1.Shaffer, Catherine. "Gene Knockout versus Knockdown." News-Medical.net, 12. februar 2018. Tilgjengelig her
2. "Gene Knockout." Nature News, Nature Publishing Group. Tilgjengelig her
Bilde Courtesy:
1.'Knockout Mice5006-300'By Maggie Bartlett, NHGRI. (Offentlig domene) via Commons Wikimedia
2.RNAi-simplified'By Matzke MA, Matzke AJM (2004) Planting frøene til et nytt paradigme. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC BY 2,5) via Commons Wikimedia
