Forskjellen mellom fremover og omvendt primer

Nøkkelforskjell - Fremover mot omvendt primer
 

Polymeraskjedereaksjon (PCR) er en DNA-amplifikasjonsmetode som brukes i molekylærbiologiske applikasjoner. Det er en vanlig teknikk som gjør millioner til milliarder eksemplarer av en spesielt interessert DNA-sekvens. Det er en in vitro metode utført i laboratorier. PCR-teknikken er helt avhengig av den kommersielt fremstilte DNA-polymerase kalt Taq-polymerase. Og det krever også flere andre komponenter og riktig vedlikehold av temperatur. En viktig komponent er primere. Primers er de korte DNA-sekvensene som er spesielt designet for mål-DNA-sekvensen. De er vanligvis rundt 20 nukleotider i lengden. Taq-polymerase katalyserer tilsetning av nukleotider til tidligereeksisterende nukleotidsekvens. Derfor blir primere servert som utgangspunkt for syntesen av nye tråder. Taq-polymerase virker bare i 5'- til 3'-retningen, og dermed forekommer DNA-syntesen i samme 5'-3'-retning. Siden DNA er dobbeltstrenget, er det nødvendig med to typer primere i PCR. De er kjent som fremre primer og revers primer. Fremover og revers primere betegnes basert på retningen av forlengelsen av primeren i DNA når DNA-syntese oppstår. Forward primer annealerer med antisense DNA-strengen og initierer syntesen av + ve-strengen av genet i 5'-til-3'-retning. Omvendt primer annealerer med sansstrengen og initierer syntesen av den komplementære streng av kodingsstrengen; som er -ve strengen av genet i 5'to 3 'retning. Dette er nøkkelforskjell mellom fremover og revers primere.

INNHOLD

1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er en Forward Primer
3. Hva er en omvendt primer
4. Likheter mellom Forward og Reverse Primer
5. Sammenligning ved siden av siden - Fremover mot omvendt primer i tabellform
6. Sammendrag

Hva er en Forward Primer?

Fremadrettet orientering er syntesen av kodingsstrengen eller sensens streng av et gen. Taq polymerase katalyserer syntesen av en ny streng i 5 'til 3' retning. Syntesen av kodingsstrengen oppstår når primeren annealerer med den ikke-kodende eller antisense-strengen og strekker seg i 5'-til-3'-retningen.

Figur 01: Forward og Reverse Primers

Primeren som annealerer med antisense-strengen eller den ikke-kodende streng eller templatstrengen er kjent som fremadrettet primer, siden fremadrettet primer virker som et utgangspunkt for syntesen av koding eller den positive streng av genet. Forward primer har en kort nukleotidsekvens som er komplementær til den 3'-flankerende enden av antisense-strengen. Den hybridiserer med antisensstrengen og letter Taq-polymerasen for å legge til nukleotider som er komplementære til malstrengen.

Hva er en omvendt primer?

Omvendt primer er den korte DNA-sekvensen som annealerer med 3'-enden av følelsesstrengen eller kodingsstrengen. Omvendt primer tjener som utgangspunkt for å syntetisere en komplementær streng av den kodende sekvensen eller den ikke-kodende sekvensen. Omvendt primer er utformet komplementær til 3'-enden av kodingsstrengen. Det annealerer derfor med den flankerende 3'-enden av kodingsstrengen og tillater Taq-polymerase å syntetisere antisensstrengen eller malstrengen. Siden orienteringen er på reversert måte, er denne primer merket som revers primer.

Både omvendt og fremover primere er viktige for produksjon av millioner til milliarder eksemplarer av bestemte DNA-regioner som er målrettet eller interessert.

Hva er likhetene mellom fremover og omvendt primer?

• Både Fremover og Omvendt primere er laget av oligonukleotider.
• Både fremover og revers-primere har kort nukleotidsekvens komplementær til de flankerende ender av DNA-dobbeltstrengene.
• Både Fremover og Omvendt primere består vanligvis av 20 nukleotider.
• Både Forward og Reverse Primers brukes i polymerasekjedereaksjoner.
• Både Forward og Reverse Primers syntetiseres kommersielt.
• Både fremover og bakover primere er temperatur stabile og de har normalt lignende Tm.
• Både Forward og Reverse Primers er annealed med mål-DNA-sekvensene.
• Både Forward og Reverse Primers er utformet i henhold til PCR-reaksjonene.
• Både Forward og Reverse Primers blir servert som utgangspunkt for DNA-amplifikasjonen.
• Både omvendte og fremre primere er viktige for produksjon av millioner eksemplarer av bestemte regioner med målrettede eller interesserte DNA-sekvenser.

Hva er forskjellen mellom fremover og omvendt primer?

Forward Primer vs Reverse Primer
Fremdriftsprimer er den korte DNA-sekvens som hybridiserer med 3'-enden av den ikke-kodende eller templatstrengen av genet og tjener som utgangspunkt for å syntetisere den kodende sekvensen.	Omvendt primer er den korte DNA-sekvensen som hybridiserer med 3'-enden av kodingen eller nontemplate-strengen og tjener som utgangspunkt for å syntetisere den ikke-kodende sekvensen.
Annealing Strand
Forward primer anneals med malstreng.	Omvendt primer anneals med nontemplate streng.
Som resulterer i ny rekkefølge
Forward primer letter syntesen av den kodende sekvensen.	Omvendt primer letter syntesen av den ikke-kodende sekvensen.

Sammendrag - Videresend mot omvendt primer

Det er to typer primere involvert i PCR-teknikk. De er frem og tilbake primere. Basert på forlengelsen av primeren i ny DNA-strengsyntese, er disse primere merket eller navngitt. Taq-polymerase syntetiserer det nye DNA i 5 'til 3' orientering. Derfor er primere utformet som komplementære til 3'-ender av de dobbelte trådene. Forward primer som strekker seg i 5 'til 3' retning hybridiserer med 3'-enden av antisensen eller malen eller den ikke-kodende sekvensen. Den tjener som utgangspunkt for å syntetisere kodingssekvensen. Omvendt primer som strekker seg i retningen 5 'til 3' hybridiserer med 3'-enden av kodingen eller nontemplatet eller sansstrengen. Den tjener som utgangspunkt for å syntetisere den ikke-kodende sekvensen. Dette er forskjellen mellom fremover og bakre primer.

Henvisning:

1. "Primer (Molekylærbiologi)." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 20. februar 2018. Tilgjengelig her 
2. "Polymerase chain reaction (PCR)." Khan Academy. Tilgjengelig her 

Bilde Courtesy:

1.Primers RevComp smeltet2'En Richard Wheeler (Zephyris) - eget arbeid, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia