Agarose og polyakrylamid er begge vannløselige polymerer, men mellom dem er det mange forskjeller som kan sees, fra deres opprinnelse. Både Agarose og Polyakrylamid har noe vanlig i deres evne til å danne porøse gelmatriser. Til tross for dette eksisterer det en rekke tydelige forskjeller mellom de to. De store forskjellene mellom begge disse polymerene ligger i deres opprinnelsesart, kjemisk struktur, deres forskjellige anvendelser og deres ytelse i form av gelelektroforese.
Agarose er en naturlig forekommende lineær polymer som igjen er avledet fra en kompleks polymer som kalles agar funnet i tang. Agarose blir ekstrahert fra agar ved fjerning av dens proteinkomponent kalt agaropektin. Agarose er det som gir agar sin evne til å danne geler.
Den store bruken av agarose er i mikrobiologiske og molekylære biologiske studier. I mikrobiologiske studier gir agarose, når den er tilsatt passende næringsstoffer, en solid base for dyrking av mikroorganismer som bakterier og sopp. Når det brukes i halvfaste konsentrasjoner, kan det være nyttig å vurdere motiliteten til disse mikroorganismer. I molekylærbiologi tjener det som et viktig verktøy for en av de mest grunnleggende oppløsningsprosessene som kalles 'gelelektroforese'eller'agarosegelelektroforese'(AGE). Gelelektroforese er en prosess som tillater oppløsning eller separasjon av nukleinsyrer eller protein basert på deres størrelse og ladning. Her tjener agarose som en porøs siltelignende gel gjennom hvilken separasjon skjer.
Agarose Struktur
Polyakrylamid er en syntetisk polymer og brukes i en rekke bransjer. Som tidligere nevnt, er bruken av den på grunn av sin evne til å danne geler. Imidlertid utnyttes dessuten evne til å beholde og avta vann i forskjellige konsentrasjoner også i ulike næringer.
Den mest utbredte og vanlig bruk av polyakrylamid er i avløpsvannbehandling. Her brukes det som et flokkuleringsmiddel for å fjerne eventuelt suspendert organisk materiale; dermed forbedrer turbiditet og klargjør vannet. En annen bruk av polyakrylamid er i papirindustrien. Her er det vant til å beholde eller drenne vann fra papirmasse etter behov. På samme måte, i landbruks- og byggebransjen, brukes den som jordbalsam for å forhindre jord erosjon og forbedre kvaliteten.
Som agarose brukes også polyakrylamid i molekylærbiologi som et viktig oppløsningsverktøy i en lignende prosess kalt 'Polyakrylamidgelelektroforese '(PAGE). I tillegg til alt dette, er polyakrylamid også brukt i malmbehandling og fremstilling av flokkuleringsmiddel for å fjerne eventuelt suspendert organisk materiale; dermed forbedrer turbiditet og klargjør vannet. En annen bruk av polyakrylamid er i papirindustrien. Her er det vant til å beholde eller drenne vann fra papirmasse etter behov. På samme måte, i landbruks- og byggebransjen, brukes den som jordbalsam for å forhindre jord erosjon og forbedre kvaliteten. I tillegg til alt dette, er Polyacrylamide også brukt i produksjon av tilsetningsstoffer, myke kontaktlinser og tekstiler.
Polyakrylamid Struktur
agarose: Agarose er en polymer av naturlig opprinnelse. Den er avledet av tang.
polyakrylamid: Polyakrylamid er av syntetisk opprinnelse og finnes ikke under noen naturlig forhold.
agarose: Den molekylære formel for agarose er C24H38O19.
polyakrylamid: Den molekylære formelen av polyakrylamid er (C 3H5NEI)n.
agarose: Agarose er et lineært polysakkarid. Den består av gjentatte disakkarid-enheter kalt agrobiose holdt sammen av hydrogenbindinger.
polyakrylamid: Polyakrylamid er en kjemisk tverrbundet polymer. Den består av akrylamidmonomerer og et tverrbindingsmiddel N, N'-metylenbisakrylamid.
agarose: Både agarose og dens monomerenhet agrobiose er giftfri i naturen.
polyakrylamid: Monomerenheten av polyakrylamid, akrylamidet, er et antatt kreftfremkallende middel og kjent nevrotoksin, mens det er polymerisert form er giftfritt i naturen.
agarose: Agarosegelpreparering for AGE er mindre tidkrevende, enkel og enkel, og krever ikke en initiator eller polymeriserende katalysator.
polyakrylamid: Polyakrylamidgelpreparering for PAGE er tidkrevende og kjedelig og krever også en initiator (ammoniumpersulfat) og polymeriserende katalysator (N, N, N ', N'-tetrametyletylendiamin - TEMED).
Polyakrylamidgeler er kjemisk mer stabile enn agarosegeler.
Gitt den samme konsentrasjon, har polyakrylamidgelmatriser en tendens til å ha mindre porestørrelser sammenlignet med den av en agarosegelmatrise.
Porestørrelsen av polyakrylamidgeler kan endres på en mer kontrollert måte enn den av agarosegeler.
Polyakrylamidgeler har høy oppløsningsevne, mens agarosegeler har lav oppløsningsevne.
Polyakrylamidgeler kan ta imot større mengder nukleinsyre enn agarosegeler for oppløsning.
Bilder Hilsen: agarose og Struktur av polyakrylamid via Wikicommons (Public Domain)