Hva er forskjellen mellom genmapping og gensekvensering
Share
De hovedforskjell mellom gen kartlegging og gen sekvensering er at gen kartlegging identifiserer generen av gener og deres relative avstand innenfor genomet mens gen-sekvenseringen stikker ut rekkefølgen av nukleotidene, som utgjør gener i genomet. Videre resulterer gen kartlegging i et mindre detaljert utfall mens gen sekvensering resulterer i et fullt detaljert utfall.
Gen kartlegging og gen sekvensering er to typer genomanalysemetoder som bidrar til å oppnå ulike typer informasjon om genomene.
Nøkkelområder dekket
1. Hva er Gene Mapping
- Definisjon, metode, betydning
2. Hva er Gene Sequencing
- Definisjon, metode, betydning
3. Hva er likhetene mellom genmapping og gensekvensering
- Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom genmapping og gensekvensering
- Sammenligning av nøkkelforskjeller
Nøkkelord
Gene-kartlegging, gensekvensering, lokalitet, nukleotidsekvens, fysisk kartlegging, relativ avstand
Hva er Gene Mapping
Gene kartlegging er identifikasjonen av generen av gener og deres relative avstand i genomet. Derfor inneholder et genkart en rekke landemerker av korte DNA-sekvenser eller regulatoriske steder, som slår på og slår av gener. Dermed er det et etdimensjonalt kart, som er lineært. Genene eller de andre viktige sekvensene i et genkart er også navngitt med bokstaver og tall; for eksempel D14S72 og GATA-P7042. Videre er måleenheten av avstanden mellom to gener sentimenter. En centimorgan er lik prosentandelen av to uavhengige arvegener. Det hjelper å utforske et bestemt genom og å navigere rundt genomet. Det bidrar også til å identifisere nye gener i genomet.
Figur 1: Gene Map i Drosophila
Gene kartlegging gjør det mulig for forskerne å identifisere generene som er involvert i sykdommer. For dette kan de kartlegge genomene av familiene som er berørt av en bestemt sykdom. Her blir de andre landemerkene som er nær de sykdomsfremkallende generene markører for det aktuelle genet. Identifiseringen av slike landemerker bidrar til å identifisere den nøyaktige plasseringen av det sykdomsfremkallende genet i genomet. Derfor vil dette innsnevre størrelsen på DNA-stykket som skal undersøkes ut av hele genomet. Deretter kan forskerne teste det valgte settet med landemerker med de samme landemerkene fra friske individer for å identifisere det nøyaktige genet knyttet til sykdommen. Således kan gen kartlegging identifisere de gener som er ansvarlige for sykdommer som Huntingtons sykdom, cystisk fibrose, etc..
Hva er Gene Sequencing
Gen-sekvensering er en mer avansert metode enn gen kartlegging. Den identifiserer hvert nukleotid i et bestemt stykke DNA. Derfor, siden det avslører opp til nukleotidnivået av DNA, kan gensekvensering gi mer detaljert informasjon om genomet. Går videre inn i metodene for gensekvensering; den viktigste metoden for gen sekvensering er hagle sekvensering. Her tillater splittring av genomet i små fragmenter karakterisering av hvert fragment. Deretter settes sekvensene av hvert fragment sammen for å oppnå hele sekvensen av genomet.
Figur 2: Forskjellen mellom genmapping og gensekvensering
Selv om gen sekvensering er helt en annen prosess, ligner den prosessen med fysisk kartlegging. Fysisk kartlegging og gen kartlegging er de to typer genomskilt kartlegging. Ved fysisk kartlegging gir restriksjonsfordøyelsen av genomet korte fragmenter, som deretter analyseres. Det ultimate fysiske kartet er laget ved å samle alle restriksjonsfragmentene sammen. Imidlertid kan fysisk kartlegging ikke gi et detaljert resultat som gensekvensering.
Likheter mellom genmapping og gensekvensering
- Gene kartlegging og gen sekvensering er to metoder for genomanalyse.
- De gir informasjon om generens plassering.
- Også begge metoder har fordeler ved bestemmelsen av sykdomsfremkallende gener i genomet.
Forskjellen mellom genmapping og gensekvensering
Definisjon
Gene kartlegging refererer til kartlegging av gene-sposisjonene på et DNA-molekyl eller kromosom og avstanden i bindingsenheter eller fysiske enheter mellom gener, mens gen-sekvensering refererer til prosessen med å fastslå sekvensen av nukleotider i et segment av DNA. Dermed forklares dette hovedforskjellen mellom gen kartlegging og gen sekvensering.
Betydning
En annen forskjell mellom genkartlegging og gen-sekvensering er at genkartleggingen identifiserer landets landemerker mens gen-sekvensering forteller sekvensen av nukleotider i genomet.
Detailedness
Utfallet av genkartleggingen gir også mindre detaljer mens utfallet av gensekvenseringen er fullstendig detaljert. Dette er også en stor forskjell mellom gen kartlegging og gen sekvensering.
Tid og kostnad
Gen-kartleggingen er imidlertid en billig metode, som er mindre tidkrevende mens gen-sekvensering er en dyr metode som tar tid.
Konklusjon
Gene kartlegging er en metode for å identifisere landemerker som gener og deres regulatoriske sekvenser i genomet. For å være spesifikk, gir den den nøyaktige plasseringen av disse landemerkene i genomet og deres relative avstander. På den annen side er gen sekvensering en avansert metode for genomanalyse, som staver ut alle nukleotidene av genomet og deres rekkefølge av utseende. Derfor er hovedforskjellen mellom genmapping og gen-sekvensering detaljering av informasjonen de gir.
Henvisning:
1. "GENOME MAP." GNN - Genome News Network, J. Craig Venter Institute, 15. januar 2003, tilgjengelig her
Bilde Courtesy:
1. "Drosophila Gene Linkage Map" Av Twaanders17 - Eget arbeid (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. "NHGRI Fact Sheet-Genetic Mapping (27058469495)" Av National Human Genome Research Institute (NHGRI) fra Bethesda, MD, USA - NHGRI Faktaark: Genetisk Mapping (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia
