Hvordan kalles enzymer
Share
Et enzym er et proteinmolekyl som kan fungere som en biologisk katalysator. Enzymer har tre karakteristiske trekk. For det første er primærfunksjonen til et enzym å øke frekvensen av en reaksjon. For det andre fungerer et bestemt enzym spesielt på et bestemt substrat, og produserer et produkt. Og for det tredje kan enzymer reguleres av lav aktivitet til høy aktivitet og omvendt. Noen enzymer er i stand til å katalysere den samme reaksjonen. De kalles isozymer. Et unikt sett på om lag 3 000 enzymer er genetisk programmert for å bli syntetisert, og gir individualitet til en celle. Hvis et enzym blir defekt, vil effekten være katastrofalt. Vanlige navn, så vel som systematiske navn, brukes til å betegne enzymer.
Denne artikkelen forklarer,
1. Hvordan kalles enzymer
2. Nemende prinsipper for enzymer
3. Nivåer av klassifisering av enzymer
Hvordan kalles enzymer
De vanlige navnene på enzymer inneholder generelt et prefiks, enten som beskriver substratets navn, enzymens effekt eller den kjemiske reaksjonen som de katalyserer. Prefikset er etterfulgt av suffikset 'ase'. Dette suffikatet betegner bare identifikasjonen at forbindelsen er et enzym. For eksempel er enzymet som bryter ned proteiner i aminosyrer, kalt "proteinase" eller "protease". På samme måte er enzymet involvert i dehydrering av alkoholer kalt "alkohol dehydrogenase". Men når man navngir noen av de opprinnelig studerte enzymer som rennin, pepsin og trypsin, brukes eldre trivielle navn. Enzymet glukosidase er vist i Figur 1. Det katalyserer omdannelsen av maltose til to glukose molekyler.
Figur 1: Glukosidase enzym
Den systematiske nomenklaturen og klassifiseringen av enzymer ved reaksjonen de katalyserer, er utviklet av International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB). Både nomenklatur og klassifisering av enzymer avtaler på grunn av deres nært gjensidig avhengighet.
Nemende prinsipper for enzymer
De tre generelle prinsippene i enzymer nomenklatur er,
1. Suksessen -ase bør bare brukes til enkelt katalytiske enheter. Det kan derfor ikke brukes på systemer som inneholder mer enn ett enzym.
2. Prinsippklassifisering og nomenklatur bør baseres på reaksjonen som et bestemt enzym katalyserer.
3. Enzymer er delt inn i grupper, avhengig av reaksjonene som er katalysert.
De funksjonsrelaterte gruppene av enzymer klassifiseres ved å tilordne kodenumre til hver gruppe. Kodenumrene er prefiksert av 'EC' sammen med fire elementer som er adskilt av poeng. De fire elementene inneholder følgende betydninger:
- Den første figuren indikerer enzymklassen.
- Den andre figuren indikerer subklassen av enzymet.
- Den fjerde figuren indikerer sub-underklassen av enzymet.
- Den femte figuren indikerer enzymets serienummer i sin underklasse.
Klassifisering av enzymer
Det øverste nivået av enzymklassifisering, navn og funksjoner er vist i tabellen under.
| Enzyme-klasser | Navn og funksjon |
| EC 1 | oxidoreductases: Tilsetning eller fjerning av vann |
| EC 2 | transferaser: Overføring av elektroner |
| EC 3 | hydro: Overføring av radikal |
| EF 4 | lyaser: Splitting eller dannelse av en C-C-binding |
| EC 5 | Isomerases: Endre geometri eller struktur av et molekyl |
| EF 6 | ligaser: Sammenkobling av to molekyler ved hydrolyse av en fosfatbinding i ATP eller et annet trifosfat. |
Tabell 1: Det øverste nivået av enzymklassifisering
Et enzym kan spesifiseres fullt ut i denne nomenklaturen. For eksempel er heksokinase en transferase (EC 2), og tilsettes en fosfatgruppe (EC 2.7) til heksosukker som inneholder en alkoholgruppe (EC 2.7.1). Derfor er nomenklaturen av heksokinase EC 2.7.1.1.
Konklusjon
Enzymer øker frekvensen av reaksjoner ved å katalysere dem. De er ofte navngitt basert på substratet som de handler om. Enzymer er også navngitt basert på hvilken type reaksjon de katalyserer. En systematisk nomenklatur, kombinert med enzymklassifisering, er utviklet av IUBMB. Enzymer utvikles til seks klasser av den systematiske enzymnomenklaturen.
Henvisning:
1. "Enzyme Nomenclature." IUBMB Biokjemisk Nomenklatur. N.p., n.d. Web. 20. mai 2017.
2. "Klassifisering og nomenklatur av enzymer ved reaksjonene de katalyserer." Enzymklassifisering. N.p., n.d. Web. 20. mai 2017.
3. "Enzymernes rolle i biokjemiske reaksjoner." Enzymer. N.p., n.d. Web. 20. mai 2017.
4. "Introduksjon til enzymer." Navngivning og klassifisering (Introduksjon til enzymer). N.p., n.d. Web. 20. mai 2017.
Bilde Courtesy:
1. "Glucosidase enzyme" Av Thomas Shafee - Eget arbeid (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
