Differkinome

Forskjellen mellom YAC og BAC vektorer

Vitenskap
Share

De hovedforskjell mellom YAC og BAC vektorer er at YAC vektorer (gjær kunstige kromosomvektorer) inneholder molekylkomponenter for replikasjon i gjær mens BAC-vektorer (bakterielle kunstige kromosomvektorer) inneholder molekylære komponenter for replikasjon inne i bakterier. Videre er størrelsen på innsatsen båret av YAC vektorer 100-1000 kb mens størrelsen på innsatsen båret av BAC vektorer er 100-200 kb. 

YAC- og BAC-vektorer er to typer kunstige vektorsystemer designet for å klone store genomiske DNA-fragmenter. De har flere anvendelser i fremstillingen av genomiske og cDNA-biblioteker.  

Nøkkelområder dekket 

1. Hva er YAC vektorer
     - Definisjon, egenskaper, konstruksjon
2. Hva er BAC vektorer
     - Definisjon, funksjoner, applikasjoner
3. Hva er likhetene mellom YAC og BAC vektorer
     - Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom YAC og BAC vektorer
     - Sammenligning av nøkkelforskjeller

Nøkkelord 

BAC vektorer, kloningskapasitet, vert, vektorkomponenter, YAC vektorer 

Hva er YAC vektorer 

YAC (Gjær kunstig kromosom) vektorer er en type kunstige kromosomer som er utformet for å transformere til gjærceller etter kloning av store DNA-fragmenter. Den består av elementene i et typisk gjærkromosom. De er; 

  1. CEN - En gjærcentromere, som sikrer segregering i to datterceller under reproduksjon. 
  2. ARS - Reproduksjonssted for autonom replikasjon inne i gjærcellen 
  3. TEL-Telleromregionen 
  4. TRP1 og URA3 - Selekterbare markørgener for valget av transformerte gjærceller 
  5. Bakterielt selekterbart markørgen 
  6. BamHI- og EcoRI-restriksjonsseter - For linearisering og innføring av DNA-fragmentet 

Konstruksjon av YAC vektorer 

  1. Linearisering av et sirkulært DNA-plasmid ved begrensningsfordøyning med BamHI 
  2. Restriksjon fordøyelse med EcoRI  
  3. Ligering med DNA-fragmentet av interesse 

    Figur 1: Konstruksjon av YAC Vector

Noen eksempler på YAC vektorer er YAC72 og YAC46. Størrelsen på DNA-fragmentet som kan settes inn i en YAC-vektor er 100-1000 kb. 

Hva er BAC vektorer 

BAC (Bakteriell kunstig kromosom) vektorer er en type kunstige kromosomer designet for å transformere til bakterier, spesielt E. coli, etter kloning av store DNA-fragmenter. Størrelsen på DNA-fragmentet som kan settes inn i en BAC-vektor er 100-200 kb. Strukturen av BAC-vektoren er basert på fruktbarhetsplasmidet / F-plasmidet. De vanlige komponentene i en BAC vektor er; 

  1. Repe - Formidler samlingen av replikasjonskomplekset 
  2. parA og parB - For partisjonering av gener under replikering 
  3. Valgbar markør - For valg av transformanter; kan være et antibiotikaresistensgen eller LacZ 
  4. T7 og SP6 - Fremme transkripsjonen av innsatsen 
  5. OriS - For den ensrettede opprinnelsen til replikering 

    Figur 2: Konstruksjon av BAC Vector

BAC vektorer ble ofte brukt i sekvensering under Human Genome Project. BAC vektorer brukes i modellering av genetiske sykdommer som Downs syndrom og nevrologiske sykdommer som Alzheimers sykdom. Også klonene av noen store DNA- og RNA-virus klones i BAC-vektorer. PAC er en lignende vektor til BAC, som er produsert basert på P1 bakteriofagen. 

Likheter mellom YAC og BAC vektorer 

  • YAC- og BAC-vektorer er kunstige vektorsystemer designet for innsetting av store DNA-fragmenter. 
  • Begge kommer som sirkulære plasmider. 
  • De har flere anvendelser i fremstillingen av genomiske og cDNA-biblioteker.  

Forskjellen mellom YAC og BAC vektorer 

Definisjon 

YAC-vektorene refererer til en vektor (bærer) konstruert fra de telomeriske, sentromere og replikasjons-opprinnelses-sekvensene som trengs for replikasjon i gjærceller mens BAC-vektorene refererer til en DNA-konstruksjon basert på et funksjonelt fruktbarhetsplasmid (eller F-plasmid) anvendt for transformering og kloning i bakterier, vanligvis E. coli.  

Vert 

YAC vektorer blir transformert til gjærceller mens BAC-vektorer blir transformert til bakterier. 

Basert på 

YAC-vektoren fremstilles basert på de spesifikke områdene av gjærekromosomet mens BAC-vektorene blir produsert basert på F-plasmidet.  

konfigurasjon 

YAC vektorer er lineære mens BAC vektorer er sirkulære. 

Kopier nummer 

En enkelt YAC-vektor oppstår per gjærcelle mens 1-2 BAC-vektorer forekommer per bakteriecelle. 

Kloningskapasitet 

YAC vektorer har høy kloningskapasitet, da innsatsen kan være opptil 1000 kb i størrelse, mens BAC-vektorer har mindre kloningskapasitet fordi innsatsen kan være opptil 200 kb i størrelse. 

Konklusjon 

YAC-vektoren er et kunstig vektorsystem med høy kloningskapasitet (opptil 1000 kb) mens BAC-vektoren er et kunstig vektorsystem med lav kloningskapasitet (opptil 200 kb) sammenlignet med YAC. YAC vektorer blir transformert til gjærceller mens BAC-vektorer blir transformert til bakterier. Hovedforskjellen mellom YAC og BAC vektorer er deres kloningskapasitet og vert.

Henvisning:

1. Monaco, Anthony P og Zoia Larin. "YAC, BAC, PAC og MAC: Kunstige kromosomer som forskningsverktøy." Trender i bioteknologi, Elsevier, 26. august 2004, tilgjengelig her

Bilde Courtesy:

1. "Konstruksjon av en YAC chem114A" Av Tinastella på engelskboksen - Overført fra en.wikibooks til Commons. (Offentlig domene) tilgjengelig her
2. "BACs kloning vektorer Chem114A" Av Tinastella (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia 

Vitenskap
×