Forskjellen mellom snRNA og snoRNA

Hovedforskjellen - snRNA vs snoRNA

snRNA og snoRNA er to typer små, ikke-kodende RNA-molekyler funnet i cellen. Både snRNA og snoRNA er involvert i å modifisere RNA like etter transkripsjonen. SnRNA er funnet i spleiseflekker og Cajal-legemer i kjernen av cellen. Den fosforylerte adapteren for kjernefysisk eksport (PHAX) er involvert i transporten av snRNA og snoRNA til virkningsstedet i kjernen. De hovedforskjell mellom snRNA og snoRNA er det snRNA er involvert i den alternative spleising av pre-mRNA-molekyler for å bestemme hvilken sekvens som skal oversettes til et protein mens snoRNA er involvert i modifisering av rRNA og tRNA, mRNA-redigering og genom-imprinting.

Nøkkelområder dekket

1. Hva er snRNA
      - Definisjon, Funksjoner, Funksjon
2. Hva er snoRNA
      - Definisjon, Funksjoner, Funksjon
3. Hva er likhetene mellom snRNA og snoRNA
      - Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom snRNA og snoRNA
      - Sammenligning av nøkkelforskjeller

Nøkkelbetingelser: Alternativ Spleising, Genome Imprinting, Modifisering av rRNA, MRNA Redigering, Små Nuclear RNA (SnRNA), Små Nukleolær RNA (SnoRNA), U-RNA

Hva er snRNA

Små kjernefysiske RNA (snRNA) er en type liten ikke-kodende RNA, omfattende 80 til 350 nukleotider i molekylene. SnRNA kalles også U-RNA og de kan bli funnet i spleiseflekker og kjerneorganer av kjernen. SnRNA er en komponent av de små kjernefysiske ribonukleoproteinene (snRNPs), som danner spliceosomet som styrer spleising av pre-mRNA-molekyler under post-transkripsjonelle modifikasjoner. Eukaryotisk pre-mRNA består av både introner og exoner. Intronene skal fjernes fra sekvensen ved å spleise exoner sammen.

Figur 1: RNA Splicing

Den alternative spleising i eukaryoter produserer forskjellige sekvenser av mRNA, som danner flere typer proteiner. En spliceosome inneholder rundt 145 proteiner. Disse proteinene spiller en rolle i genuttrykk i stedet for spleising. De fem typene snRNP er involvert i spleising er U1, U2, U4, U5 og U6. U2 og U6 begynner spleising. Fjernelsen av introner fra pre-mRNA-molekyler oppnås basert på tre sekvenser. De er et 5-splittersted, et grensepunkt og en 3'-splisseplass. Vanligvis begynner introner med en GT og slutter med et AT. Den alternative spleising oppnås ved komplementær baseparering av et GT-sted med AT-sted for en annen intron. Rundt 15% enkeltpunktsmutasjoner i pre-mRNA kan påvirke spleisingsprosessen. RNA-spleising er vist i Figur 1. 

Hva er snoRNA

Liten nukleolær RNA (snoRNA) er den andre typen liten ikke-kodende RNA som er involvert i modifikasjon og behandling av rRNA og tRNA-forløpere. Hovedfunksjonen til snoRNA er modningen av rRNA under dannelsen av ribosomet. SnoRNA er involvert i mRNA-redigering og genominntrykking også. SnoRNA kan være 80 til 1000 nukleotider i lengde i gjær.

Figur 2: Sekundær struktur av C / D-boksen snoRNA

To typer snoRNA kan identifiseres basert på de forskjellige og evolusjonært konserverte sekvenselementene som finnes i hver snoRNA. De er C / D-boksen og H / ACA-boksen snoRNAs. C / D-boksen er involvert i 2'-O-metyleringen, og H / ACA-boksen er involvert i pseudo-uridyleringen. Noen av snoRNAene er allestedsnærværende, noen er vevsspesifikke, og de andre er påtrykt. Den sekundære strukturen til C / D-boksen snoRNA er vist i figur 2. 

Likheter mellom snRNA og snoRNA

• snRNA og snoRNA er typer små ikke-kodende RNA i cellen.
• Både snRNA og snoRNA er involvert i å modifisere RNA inne i kjernen.
• Den fosforylerte adapteren for kjernefysisk eksport (PHAX) er involvert i transporten av hver snRNA og snoRNA til virkningsstedet i kjernen..

Forskjellen mellom snRNA og snoRNA

Definisjon

snRNA: snRNA er en klasse av lite RNA som finnes i kjernen til eukaryoter, involvert i pre-mRNA-behandlingen.

snoRNA: snoRNA er en type liten RNA, som styrer kjemiske modifikasjoner av rRNA og andre RNAer som tRNA og snRNA.

Står for

snRNA: snRNA står for lite kjernefysisk RNA.

snoRNA: snoRNA står for liten nukleolær RNA.

Funnet i

snRNA: snRNA finnes bare i eukaryoter.

snoRNA: snoRNA finnes i både eukaryoter og archaea.

Størrelse

snRNA: snRNA-molekylet er 80 til 350 nukleotider langt.

snoRNA: snoRNA er 80 til 1000 nukleotider i lengde i gjær.

Funksjon

snRNA: siRNA er involvert i alternativ spleising i eukaryoter.

snoRNA: snoRNA er involvert i mRNA-redigering, modifisering av rRNA og tRNA, og genom-imprinting.

Konklusjon

snRNA og snoRNA er to typer små, ikke-kodende RNA som er involvert i behandlingen av forløper RNA. SnRNA er involvert i spleising av eukaryotisk mRNA under post-transkripsjonelle modifikasjoner. SnoRNA er involvert i modning av rRNA og tRNA. Derfor er hovedforskjellen mellom snRNA og snoRNA deres funksjon i forløper-RNA-behandlingen.

Henvisning:

1. "SnRNAs er nødvendig for spleising." CELLS. N.p., n.d. Web. Tilgjengelig her. 24. juli 2017. 
2. "Eukaryotiske snoRNA: Et paradigme for genuttrykks fleksibilitet." ScienceDirect. N.p., n.d. Web. Tilgjengelig her. 24. juli 2017. 
3. "MER FUNKSJONAL RNA MOLECULES." GENETIKK. N.p., n.d. Web. Tilgjengelig her. 24. juli 2017. 

Bilde Courtesy:

1. "RNA splicing diagram en" Av LadyofHats (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. "RF00071" - hentet fra Rfam-databasen (Public Domain) via Commons Wikimedia