Forskjellen mellom sgRNA og gRNA

sgRNA er single guide RNA, et begrep som brukes til å beskrive gRNA, mens gRNA er det guidede RNA, et RNA-molekyl som brukes til å spesifisere et bestemt mål for endonukleaser i CRISPR-systembasert genomredigering. Derfor, både sgRNA og gRNA er utbyttbare termer som brukes til å beskrive det samme molekylet. Det er ikke mye forskjell mellom sgRNA og gRNA.

Både sgRNA og gRNA er syntetiske molekyler og ligner crRNA i CRISPR-systemet ved funksjon. 

Nøkkelområder dekket

1. Hva er sgRNA
     - Definisjon, Betydning
2. Hva er gRNA
     - Definisjon, struktur, funksjon
3. Hva er likhetene mellom sgRNA og gRNA
     - Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom sgRNA og gRNA
     - Sammenligning av nøkkelforskjeller

Nøkkelord

Cas, CRISPR-basert genom redigering, gRNA, sgRNA, Spacer Sequence 

Hva er sgRNA 

sgRNA (single guide RNA) er et annet begrep som brukes til å beskrive gRNA. 

Figur 1: sgRNA

Hva er gRNA 

gRNA (guide RNA) er et kort, syntetisk RNA-molekyl som brukes i CRISPR-systembasert genomredigering, en av de svært spesifikke typer genommodifikasjonsverktøy. gRNA består av en ~ 20 bp lang nukleotidsekvens som binder til en mål-DNA-sekvens av genomet. Denne sekvensen kalles spacer sekvens. GRNA-molekylet er sammensatt av en stillasekvens for bindingen av Cas, endonukleasen. Så, de to komponentene i CRISPR-basert genomredigering er gRNA og CRISPR-tilknyttet endonuklease (Cas). På den annen side endrer genomålet for CRISPR-systemet med sekvensen av gRNA. 

Figur 2: gRNA-rolle i genomredigering

Tre typer gRNA er der basert på syntesemetoden. De er syntetisk crRNA, lentiviral sgRNA og syntetisk sgRNA.  

Likheter mellom sgRNA og gRNA 

• sgRNA og gRNA er små RNA-molekyler som brukes til å spesifisere målsekvensen til endonukleaser i genomredigeringsverktøyene basert på CRISPR-systemet. 
• Begge har en 20 bp region som hybridiserer med DNA. 
• Begge er kunstige molekyler og forekommer ikke i naturen. 
• Begge utfører den samme funksjonen, dvs. funksjonen crRNA utfører i det naturlige CRISPR-systemet. 

Forskjellen mellom sgRNA og gRNA 

Definisjon 

sgRNA (single guide RNA) refererer til gRNA som brukes i det kunstige CRISPR-systemet mens gRNA (guide RNA) refererer til de korte, syntetiske RNA-sekvensene som spesifiserer målsekvensen for CRISPR-basert genom-redigering. 

• Både sgRNA og gRNA er utbyttbare termer som brukes til å beskrive det samme molekylet

Konklusjon 

sgRNA er et annet begrep for gRNA mens gRNA er de korte, syntetiske RNA-sekvensene som brukes til å spesifisere målsekvensen i genomet for endonukleasen i CRISPR-systemet. Både sgRNA og gRNA er en av komponentene i CRISPR-basert genom-redigering. Derfor er hovedforskjellen mellom sgRNA og gRNA bare terminologien. 

Henvisning:

1. "CRISPR Guide." Addgene: CRISPR Guide, Tilgjengelig her

Bilde Courtesy:

1. "15 Hegasy Cas9 DNA Tool Wiki E CCBYSA" Av Guido4 - Eget arbeid (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 
2. "CRISPR-Cas9-biologist" Av J LEVIN W - Eget arbeid (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia