Forskjellen mellom valgbar markør og reportergen

De hovedforskjell mellom selekterbar markør og reportergen er at selekterbar markør brukes til å skille mellom transformanter og ikke-transformanter mens reportergenet brukes til å måle ekspressjonsnivået for det transformerte genet. Videre har selekterbart markørgen sin egen promotor mens uttrykket av reportergen reguleres av promotoren til det transformerte genet.

Selekterbar maker og reportergen er to typer gener som brukes til å analysere transformanter i studier som produserer transgene organismer.

Nøkkelområder dekket

1. Hva er en valgbar markør
     - Definisjon, Formål, Eksempler
2. Hva er et Reporter-gen
     - Definisjon, Formål, Eksempler
3. Hva er likhetene mellom Selectable Marker og Reporter Gene
     - Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom valgbar markør og reportergen
     - Sammenligning av nøkkelforskjeller

Nøkkelord

Gene Expression Analysis, Gene of Interest, Reporter Gene, Selectable Marker, Transformants

Hva er en valgbar markør

Selekterbar markør er en type markørgener som vanligvis ligger i plasmidet. Det transformeres til vertscellen ved hjelp av plasmidet. Transformanter som inneholder selekterbar markør, kan vokse i det tilsvarende selekterbare medium. Men de ikke-transformantene, som mangler den valgbare markøren, kan ikke vokse i det valgbare medium. Dette betyr at genproduktet av den selekterbare markøren blir valgfaktoren for overlevelse.

De tre gruppene av selekterbare markører er antibiotikaresistensgener, antimetabolittmarkørgener og herbicidresistensgener. De mest brukte selektive markørene er de antibiotiske resistensgenene. Derfor kan bare transformantene vokse i mediet, som inneholder det tilsvarende antibiotika.

Valgbar markør 

Figur 1: Rolle av antibiotikaresistente gener i molekylær kloning

Imidlertid kan alle transformanter ikke inneholde genet av interesse. Noen transformanter kan bare ha vektoren med den valgbare markøren. Sekvenserings- eller genuttrykksanalyse tillater kun deteksjon av rekombinanter som har genet av interesse.

Hva er et Reporter-gen

Reportergen er en type markørgener som brukes til å kvantifisere genuttrykket. De er fusjonert til regulatorisk sekvens av genet av interesse. Bortsett fra analysen av uttrykket av genet av interesse, tillater reportergener å studere funksjonen av genregulerende elementer og effekten av transkripsjonsfaktorer på genuttrykket. Også reportergener er avgjørende for identifisering av det vevsspesifikke eller stikspesifikke genuttrykk.

Figur 2: Rapportørens rolle

Grønn fluorescerende protein (GFP) og luciferase er den vanligste typen reportergener. GFP er et glødende protein under UV-lys. Tilstedeværelsen av andre fluorescerende proteiner som røde og gule fluorescerende proteiner tillater identifisering av forskjellige proteiner i det samme system. Luciferase er et enzym som katalyserer produksjon av gulgrønn eller blått lys fra substratet luciferin.

Likheter mellom Selectable Marker og Reporter Gene

• Selekterbar markør og reportergen er to typer markørgener som brukes til å analysere transformanter.
• De forvandles til vertsorganismen sammen med genet av interesse.
• Begge typer reportergener er ikke tilstede i vertscellen under normale forhold. Derfor er de fremmede for vertscellen.

Forskjellen mellom valgbar markør og rapportgenerering

Definisjon

Den selekterbare markøren refererer til et gen som uttrykker at man kan identifisere celler som har blitt transformert eller transfektert med en vektor som inneholder markørgenet mens reportergenet refererer til et gen som brukes til å "merke" et annet gen eller en DNA-sekvens av interesse, slik som en promotor.

Betydning

Valgbar markør bidrar til å skille mellom transformanter og ikke-transformanter mens reportergen bidrar til å måle mengden av ekspresjon av det transformerte genet.

Arrangøren

Den selekterbare markør har sin egen promotor mens reportergen er regulert under promotoren til det transformerte genet.

plassering

Selekterbar maker kan være i plasmidet eller i genkonstruksjonen mens reportergen er mellom promotoren og genet av interesse.

Resultat

Transformerte celler med den selekterbare produsenten kan vokse i selekterbart medium, men ikke-transformanten kan ikke vokse siden de mangler den selekterbare markør mens mengden av genprodukt i reportergenet avhenger av mengden vellykkede transformerte gener av interesse.

eksempler

Antibiotikaresistensgener, antimetabolittmarkørgener og herbicidresistensgener er typene selekterbare markører mens GFP og luciferase er noen reportergener.

Konklusjon

De valgbare markørene er markørgenene som brukes til å skjerme transformanter i det tilsvarende selekterbare medium mens reportergenene er markørgener for å måle mengden av ekspresjon. Hovedforskjellen mellom selekterbare markør- og reportergener er typen av screening.

Henvisning:

1. Jha, Nandkishor. "Valgbare markørgener og reporterer." Biologisk diskusjon, 16. oktober 2015, tilgjengelig her
2. "Reporter Gene Assays." Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, tilgjengelig her

Bilde Courtesy:

1. "Steps of Molecular Cloning" Av Alexpicardal97 - Eget arbeid (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 
2. "Reporter gen" Av TransControl på en.wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia