Forskjellen mellom gjentatt DNA og satellitt DNA

Hovedforskjell - Repeterende DNA vs Satellitt DNA

Gjentatt DNA og satellitt DNA er to typer DNA funnet i genomet av de fleste eukaryoter. De hovedforskjell mellom repeterende DNA og satellitt DNA er det repeterende DNA er små sekvenser av DNA som gjentas hundrevis eller tusen ganger, mens satellitt DNA er svært repeterende DNA-sekvenser, som utgjør en betydelig del av genomet. De to typer gjentakelser som er funnet i genomet er tandem-gjentakelser og gjentatte repeter. Satellitt DNA består av mange tandem gjentakelser av en kort grunnleggende repeterende enhet. Den ligger på spesifikke kromosomer av det menneskelige genom og nær kromosomens sentromerer.

Nøkkelområder dekket

1. Hva er Repeterende DNA
     - Definisjon, fett, typer
2. Hva er satellitt DNA
     - Definisjon, fakta, typer
3. Hva er likhetene mellom gjentatt DNA og satellitt DNA
     - Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom gjentatt DNA og satellitt DNA
     - Sammenligning av nøkkelforskjeller

Nøkkelbetingelser: Interspersed Repeats, Microsatellites, Minisatellites, Repetitive DNA, Satellite DNA, Tandem Repeats

Hva er Repeterende DNA

Gjentatt DNA refererer til strekningene av DNA som gjentar gjennom genomet. Det representerer en viss mengde av det ikke-kodende DNA spredt gjennom eukromatinet. Den repeterende enheten kan bestå av få basepar til hundrevis av basepar. Den gjennomsnittlige størrelsen på den repeterende enheten er 300 bp. Det kan gjentas for 10-10⁵ kopier per genom. De to hovedtyper av repeterende DNA er tandem gjentakelser og gjentatte repeter. Tandem gjentakelser er vist i Figur 1.

Figur 1: Tandem gjentakelser

I tandem gjentakelser ligger kopiene av en repeterende sekvensenhet ved siden av hverandre, danner en blokk eller en matrise. Satellitt DNA er en type tandem gjentakelser. I interspersed repeats dispergeres de repeterende sekvensene gjennom genomet som enkelt enheter flankert av en unik sekvens. De transponerbare elementene som DNA transposoner og retrotransposoner er gjentatte repeter.

Hva er satellitt DNA

Satellitt DNA refererer til korte, repeterende, DNA-sekvenser som ofte finnes i sentromeriske regioner av genomet. Det er de viktigste funksjonelle enhetene til centromere. Satellitt DNA finnes også i heterochromatin som en viktig strukturell bestanddel. I det menneskelige genomet, kan satellitt DNA finnes i kromosomer 1, 9 og 16 og de korte armer av kromosomer 13-15, 21 og 22. Satellitt DNA er en type tandem gjentakelser. Den består av korte nukleotidsekvenser rundt 60 bp som gjentas mer enn 10⁶ ganger i genomet. De to hovedtyper av satellitt DNA er minisatellitter og mikrosatellitter. En minisatellitt-sekvens er vist i figur 2.

Figur 2: Minisatellitt DNA

Minisatellitter består av 10-60 basepar i den gjentatte enheten. De ligger mange steder i genomet, inkludert sentromerer. Mikrosatellitter består av mindre enn 10 basepar i den gjentatte enheten, og de er hovedsakelig funnet i telomerer.

Likheter mellom gjentatt DNA og satellitt DNA

• Gjentatt DNA og satellitt DNA er to typer DNA funnet i det eukaryote genom.
• Både repetitivt DNA og satellitt DNA består av gjentatte sekvensenheter.
• Både repeterende DNA og satellitt DNA er typer ikke-kodende DNA.
• Både repeterende DNA og satellitt DNA kodes ikke for proteiner.
• Både repeterende DNA og satellitt DNA ligger i intergeniske regioner.
• Både repeterende DNA og satellitt DNA er viktige for å opprettholde strukturen av genomet.

Forskjellen mellom gjentatt DNA og satellitt DNA

Definisjon

Gjentatt DNA: Gjentatt DNA refererer til strekningene av DNA som gjentar gjennom genomet.

Satellitt DNA: Satellitt DNA refererer til de korte repeterende DNA-sekvensene som ofte finnes i sentromeriske regioner av genomet.

Typer av repeterende sekvenser

Gjentatt DNA: Repetitivt DNA består av enten tandem-gjentakelser eller gjentatte repeter.

Satellitt DNA: Satellitt DNA består av tandem gjentakelser.

Størrelsen på den gjentatte enheten

Gjentatt DNA: Gjentatt DNA kan bestå av få basepar til hundrevis av basepar i den repeterende enheten.

Satellitt DNA: Satellitt DNA består av korte repeterende enheter (opptil 60 basepar lange). 

Grad av gjentagelse

Gjentatt DNA: Gjentatt DNA er moderat repeterende sekvenser (10-10⁵ gjentakelser per genom).

Satellitt DNA: Satellitt DNA består av svært repeterende sekvenser (> 10⁶ gjentakelser per genom).

Lokalisert i

Gjentatt DNA: Repetitivt DNA er plassert i de genene som er genstand for genene.

Satellitt DNA: Satellitt DNA ligger på spesifikke kromosomer og sentromerer av kromosomene.

typer

Gjentatt DNA: De to hovedtyper av repeterende DNA er tandem gjentakelser og gjentatte repeter.

Satellitt DNA: De to hovedtyper av satellitt DNA er mikrosatellitter og minisatellitter.

rolle

Gjentatt DNA: Gjentatt DNA tjener som en evolusjonær enhet, som katalyserer dannelsen av nye gener.

Satellitt DNA: Satellitt DNA har en viktig rolle i DNA fingeravtrykk.

I CsCl Density Gradient analyse

Gjentatt DNA: Gjentatt DNA fremstår som lysbånd.

Satellitt DNA: Satellitt DNA vises som små mørke band.

Konklusjon

Gjentatt DNA og satellitt DNA er to typer DNA-gjentagelser funnet i genomet. Repeterende DNA er moderat gjentatte DNA-sekvenser mens satellitt-DNA er høyt gjentatte, korte DNA-sekvenser. Hovedforskjellen mellom repeterende og satellitt DNA er graden av repetisjon.

Henvisning:

1.López-Flores, I., og M.A. Garrido-Ramos. "Det gjentatte DNA-innholdet i eukaryotiske genomer." Karger Publishers, 25. juni 2012, Tilgjengelig her.
2.Garrido-Ramos, Manuel A. "Satellitt DNA: En utviklende emne." Genes, MDPI, september 2017, Tilgjengelig her.

Bilde Courtesy:

1. "VNTR2individuals5or7repeats" Av Madelyndotson - Eget arbeid (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia