Forskjellen mellom cDNA og genomisk DNA
Share
Hovedforskjell - cDNA vs genomisk DNA
Komplementært DNA (cDNA) og genomisk DNA er to typer DNA-molekyler som brukes i forskningseksperimentene i molekylærbiologi. Både cDNA og genomisk DNA består av DNA-nukleotider. cDNA produseres ved revers transkripsjon av det ekstraherte RNA fra vev. De typer RNA som brukes for revers transkripsjon, kan være totalt RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomalt RNA eller tRNA. Imidlertid kan genomisk DNA isoleres direkte fra cellen. De hovedforskjell mellom cDNA og genomisk DNA er det cDNA representerer transkriptomet til en bestemt organisme, mens genomisk DNA representerer genomet.
Nøkkelområder dekket
1. Hva er cDNA
- Definisjon, fakta, rolle
2. Hva er genomisk DNA
- Definisjon, fakta, rolle
3. Hva er likhetene mellom cDNA og genomisk DNA
- Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom cDNA og genomisk DNA
- Sammenligning av nøkkelforskjeller
Nøkkelbetingelser: Komplementært DNA (cDNA), genom, genomisk DNA (gDNA), revers transkripsjon, RNA, transkriptom
Hva er cDNA
cDNA (komplementært DNA) refererer til det syntetiske DNA hvis basesekvenser er komplementære til DNA. Den er produsert fra omvendt transkripsjon av RNA-maler. Total RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomalt RNA eller tRNA kan brukes til revers transkripsjon. Omvendt transkriptase er enzymet som katalyserer reaksjonen av å produsere cDNA fra RNA. Den omvendte transkripsjon kombinert med PCR er vist i Figur 1.
Figur 1: Omvendt transkripsjon kombinert med PCR
cDNA brukes hovedsakelig i kloning av eukaryotiske gener i de prokaryotiske genomene. Exons består av den kodende regionen av proteiner. I eukaryoter avbrytes kodende regionen av introner. Under transkripsjonen er både introner og exoner kodet inn i pre-mRNA. Men under mRNA-prosessen fjernes intronene fra mRNA, og produserer et modent mRNA ved å spleise exonene sammen. Den totale mRNA av en organisme kalles transkriptomet. Imidlertid mangler prokaryoter mRNA-behandlingsmekanismer. MRNA brukes således til å syntetisere cDNA som bare inneholder proteinkodingområder av genomet. Denne cDNA brukes til å klone gener i prokaryoter. cDNA produseres naturlig i retrovirus under konvertering av RNA-genomet i DNA.
Hva er genomisk DNA
Genomisk DNA (gDNA) refererer til det totale settet av kromosomalt DNA i genomet. Det totale settet av gener av en bestemt organisme er referert til dens genom. Imidlertid er ikke bare genene av genomet aktive. De fleste grupper av organismer har lignende typer genomisk DNA i gruppen. Genet av organismen går fra neste generasjon til den andre. Vanligvis består genomene av et stort antall basepar. Som et eksempel består det menneskelige genomet av rundt 3 milliarder basepar. Kromosomene av det humane genomet er vist i figur 2.
Figur 2: Kromosomer av det humane genom
De fire typene sekvenser som finnes i det genomiske DNA er proteinkoding-gener, tandemly gjentatte gener, repeterende DNA og spacer-DNA. Genomisk DNA brukes i mange eksperimenter i molekylærbiologi. Isoleringen av genomisk DNA er lett sammenlignet med fremstillingen av cDNA. Genomisk DNA kan brukes som PCR maler, i kloning, sekvensering, forbereder genomiske biblioteker, DNA fingeravtrykk, studerer genstrukturer og påviser mutasjoner / abnormiteter.
Likheter mellom cDNA og genomisk DNA
- cDNA og genomisk DNA er to typer DNA-molekyler som brukes i forskningseksperimentene i molekylærbiologi.
- Både cDNA og genomisk DNA består av DNA-nukleotider.
- Både cDNA og genomisk DNA består av en sukker-fosfat-ryggrad.
- Både cDNA og genomisk DNA er dobbeltstrengede molekyler.
- Både cDNA og genomisk DNA er sammensatt av exoner.
Forskjellen mellom cDNA og genomisk DNA
Definisjon
cDNA: cDNA er det syntetiske DNA hvis basesekvenser er komplementære til genomisk DNA.
Genomisk DNA: Genomisk DNA er det totale settet av kromosomalt DNA i genomet.
Representere
cDNA: cDNA representerer transkriptomet.
Genomisk DNA: DNA representerer genomet.
Syntetisert / Hentet fra
cDNA: cDNA syntetiseres fra revers transkripsjon av forskjellige typer RNA.
Genomisk DNA: Genomisk DNA kan ekstraheres fra eksisterende genomer.
Innhold
cDNA: cDNA består av exoner eller kodende regioner.
Genomisk DNA: Genomisk DNA består av kodende og ikke-kodende sekvenser av en organisme.
Mengde
cDNA: cDNA inneholder noen basepar.
Genomisk DNA: Genomisk DNA inneholder et stort antall basepar.
Bruk
cDNA: cDNA brukes til å produsere cDNA-biblioteker.
Genomisk DNA: Genomisk DNA kan brukes til å produsere genomiske biblioteker.
Konklusjon
cDNA og genomisk DNA er to typer DNA-molekyler som brukes i ulike typer eksperimenter i molekylærbiologi. cDNA syntetiseres fra RNA, og består bare av exoner. Derfor representerer den transkriptomet av en organisme. Genomisk DNA kan lett ekstraheres fra cellens kjerne. Den består av både kodende og ikke-kodende regioner. Den representerer genomet til en bestemt organisme. Hovedforskjellen mellom cDNA og genomisk DNA er den type DNA som er tilstede i hver type DNA-molekyler.
Henvisning:
1. "CDNA (komplementær DNA)." Menneskelige gener, tilgjengelig her.
2. "GDNA - Genomisk DNA | Avansert Analytisk (AATI). "Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), Tilgjengelig her.
3. "Genomisk DNA-isolasjon og applikasjoner." Scribd, tilgjengelig her.
Bilde Courtesy:
1. "Omvendt transkripsjonspolymerasekjedereaksjon" Av Jpark623 - Eget arbeid (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Human genom til gener" (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia
