Forskjellen mellom eukaryotiske og prokaryotiske promotorer

Nøkkelforskjell - Eukaryotisk mot prokaryotiske promotorer
 

Transskripsjon er prosessen med å konvertere den genetiske informasjonen lagret i den kodende DNA-sekvens i mRNA-sekvensen. En spesifikk region av DNA lokalisert ved 5'-enden av transkripsjonsenheten initierer denne prosessen. Den regionen er kjent som promotorregionen. Disse promotorer er vanligvis funnet ved siden av transkripsjonsstartstedet. Lengden på en promotor varierer fra 100 bp til 1000 bp. Promotere er forskjellige i henhold til typen organisme. Eukaryote og prokaryote promotorer er forskjellige fra hverandre. I prokaryoter er det bare funnet tre typer promotorsekvenser nemlig -10 promoters, -35 promotor og oppstrøms elementer. I eukaryoter, Det er mange forskjellige promotorelementer som TATA-boks, initiatorelementer, GC-boks, CAAT-boks, etc.. Dette er nøkkelforskjell mellom eukaryote og prokaryote promotorer.

INNHOLD

1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er eukaryotiske promotere
3. Hva er prokaryotiske promotere
4. Likheter mellom eukaryotiske og prokaryotiske promotorer
5. Side ved side-sammenligning - Eukaryotiske vs Prokaryotiske Promotere i Tabellform
6. Sammendrag

Hva er eukaryotiske promotere?

Tre hoveddeler; kjernepromotor, proksimal promotor og distal promotor, danner kollektivt en promotor. I sammenheng med eukaryoter finnes det mange antall promotorelementer som er svært sofistikerte og mer mangfoldige enn promotorer. Det har blitt funnet ut at, på grunn av denne kompleksiteten til de eukaryote promotorer, har DNAet muligheten til å kaste seg tilbake på seg selv. Dette forklarer også det faktum at effekten av mange regulatoriske sekvenser finner sted selv om de ligger mange kilobaser unna transskripsjonsstedet. Disse eukaryote promotorer har evnen til å spenne gjennom et bredt spekter av DNA-sekvenser.

Figur 01: Eukaryotisk promotor

Eksempler på noen eukaryotiske promotorer er Pribnow-boks (TATA-boks), GC-boks, CAAT-boks etc. I sammenheng med TATA-boks, Det er en sekvens av 5 '- TATAA -3' som er til stede i kjernepropreneområdet. Til TATA-boksen er transkripsjonsfaktorproteiner og histonproteiner bundet. Bindingen av transkripsjonsfaktorproteiner til TATA-boksen assisterer i bindingen av RNA-polymerase, som deretter resulterer i dannelsen av transkripsjonskompleks. Enkelt sagt vil bindingen av disse proteinene føre til transkripsjonsprosessen. Denne prosessen vil bli hemmet når histonproteiner blir bundet til TATA-boksen. Derfor er TATA-boksen et viktig promotorelement som involverer i regulering av frekvensen av eukaryotisk transkripsjon.

Hva er prokaryotiske promotere?

I prokaryote organismer er promotoren som involverer i transkripsjon identifisert av den tilknyttede faktoren kalt sigmafaktor. Sigma-faktorer er unike for forskjellige promotorsekvenser. Derfor er det sagt at hver enkelt sigma-faktor ville gjenkjenne en enkeltkjernepromotor-sekvens. Dette er en unik egenskap som er tilstede i den prokaryotiske transkripsjonsprosessen. Både RNA-polymerase og sigmafaktoren identifiserer kollektivt den riktige promotorregionen og danner transskripsjonskomplekset.

Den prokaryote promotoren inneholder bare tre typer promotorelementer. Den mindre involvering av promotorelementer i prokaryoter er hovedårsaken til at deres transkripsjonsprosess er mindre sofistikert sammenlignet med eukaryotisk transkripsjon som involverer et høyere antall promotorsekvenser. Av de tre promotorelementene av prokaryoter er det to hoved viktige to korte DNA-sekvenser. Disse sekvensene er klassifisert etter deres plassering. De er -10 promotorer eller element (som er tilstede 10bp oppstrøms for transkripsjonsstartsted), -35 promotorer eller element (som er tilstede 35bp oppstrøms for transkripsjonsstartsted).

Figur 02: Prokaryotisk promotor

10-promotoren er ekvivalent med den eukaryote TATA-boksen eller Pribnow-boksen og er en viktig komponent for initiering av transkripsjon i prokaryoter. Den -35-promotoren består av en sekvens som er TTGACA som aktivt involverer i reguleringen av frekvensen av prokaryotisk transkripsjon.

Hva er likhetene mellom eukaryotiske og prokaryotiske promotere?

• I begge typer styres promotorene av forskjellige DNA-regulatoriske sekvenser som inkluderer forsterkere, lyddempere, isolatorer og grenseelementer.
• Promotere er sekvensene som initierer transkripsjon i prokaryoter og eukaryoter.
• Promotere er DNA-sekvenser.

Hva er forskjellen mellom eukaryotiske og prokaryotiske promotere?

Eukaryotiske vs Prokaryotiske Promotere
Eukaryote promotorer er regulatoriske sekvenser som initierer transkripsjon av eukaryotiske organismer.	Prokaryotiske promotorer er regulatoriske sekvenser som initierer transkripsjon av prokaryotiske gener.
Elements
Prokaryotisk promotor består av oppstrøms elementer, -10 element og -35 elementer.	Eukaryotisk promotor består av Pribnow-boks (TATA-boks), CAAT-boks, GC-boks og initiatorelementer.

Sammendrag - Eukaryotisk mot prokaryotiske promotorer

En promotor er en DNA-region som involverer initiering av prosessen kalt transkripsjon. Disse promotorer er vanligvis funnet oppstrøms for transkripsjonsstartstedet. De tre hoveddelene som danner en promotor er kjernepromotor, proksimal promotor og distal promotor. I sammenheng med eukaryoter er det mange antall promoterende elementer i promotorregionen som er svært sofistikerte og mer varierte enn prokaryoter. Eksempler på noen eukaryotiske promotorelementer er Pribnow-boks (TATA-boks), GC-boks, CAAT-boks etc. I prokaryoter er det to viktige viktige promotorelementer nemlig -10 element (som er tilstede 10bp oppstrøms for transkripsjonsstartsted), -35 elementer (som er tilstede 35bp oppstrøms for transkripsjonsstartsted). -10-promoteren initierer transkripsjonen, og -35-promotoren regulerer transkripsjon. Begge typer promotorer styres av forskjellige DNA-regulatoriske sekvenser som inkluderer forsterkere, lyddempere, isolatorer og grenseelementer. Dette er forskjellen mellom eukaryotiske og prokaryote promotorer.

Last ned PDF av Eukaryotic vs Prokaryotic Promoters

Du kan laste ned PDF-versjonen av denne artikkelen og bruke den til nettbasert bruk som per sitatnotat. Vennligst last ned PDF-versjonen her: Forskjellen mellom eukaryotisk og prokaryotisk promotor

Henvisning:

1.Kanhere, A. "Strukturelle egenskaper til promotorer: likheter og forskjeller mellom prokaryoter og eukaryoter." Nucleic Acids Research, vol. 33, nr. 10. februar 2005, s. 3165-3175., Doi: 10.1093 / nar / gki627.
2. "Promoters." Addgene. Tilgjengelig her 

Bilde Courtesy:

1.'Gene struktur eukaryote 2 annotert 'Av Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). "Eukaryotisk og prokaryotisk genstruktur". WikiJournal of Medicine 4 (1). DOI: 10,15347 / wjm / 2017,002. ISSN 20024436., (CC BY 4,0) via Commons Wikimedia
2.'Figure 15 02 01 'By CNX OpenStax, (CC BY 4,0) via Commons Wikimedia