Forskjellen mellom kosmid og phagemid

De nøkkelforskjell mellom Cosmid og Phagemid er på typen av sekvenser den inneholder. En Cosmid inneholder et cos-sted og et plasmid. Derfor er det en hybridvektor mens et fagemid er et plasmid som inneholder en F1 opprinnelse av replikasjon av F1-fagen.

Kosmider og fagmider brukes til kloning, spesielt for å klone større fragmenter av DNA. Disse er mye brukt spesielt i kloning gener som er ansvarlig for produksjon av ulike proteiner. Kosmider og fagmider replikeres enten alene som plasmider eller pakkes inn i virale partikler og replikeres deretter.

INNHOLD

1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er en Cosmid
3. Hva er et phagemid
4. Likheter mellom kosmid og phagemid
5. Side ved side-sammenligning - Cosmid vs Phagemid i tabellform
6. Sammendrag

Hva er en Cosmid?

Et kosmid, referert som et hybridplasmid, omfatter cos-steder ekstrahert fra Lambda-fagpartikler og et plasmid. Disse cos-stedene er lange fragmenter av DNA med 200 basepar. Derfor har de kohesive eller klebrige ender som tillater at plasmidet passer inn i det virale DNA. Derfor er cos-områdene avgjørende for emballering av DNA.

Det er tre cos steder;

• cosN-sted - involvert i nicking av DNA-strengen ved terminaseaktivitet
• cosB-sted - engasjert i å holde terminalen.
• cosQ-sted - involvert i å forhindre nedbrytning av DNA ved DNaser.

Figur 01: Kosmid

Kosmider kan også enten replikere enkeltstrenget DNA eller dobbeltstrenget DNA ved bruk av en egnet replikasjonsstart. Kosmider inneholder vanligvis antibiotikaresistensgener som markører for valg av transformanter. Bruken av et kosmid som vektor kan således lette kloning, og restriktionsenzymfordøyelsen av vektoren kan deretter ekstrahere disse fragmentene.

Hva er et phagemid (fasmid)?

Fagemid, også betegnet som fasmid, er også en type hybridvektor. Phagemid inneholder en spesiell replikasjonsoriginasjon som kalles f1-opprinnelsen til replikasjon. F1-opprinnelsen til replikasjonsekstrakter fra en f1-fag.

Phagemid kan replikere både enkeltstrenget og dobbeltstrenget DNA. Replikasjon kan enten finne sted som et plasmid mens det gjennomgår uavhengig replikasjon eller kan pakkes inn i fagpartikler og til slutt infisere bakteriell vert E coli. Når infisere E coli celler, krever f1-fagen tilstedeværelse av pilus. Derfor er sexpili viktig under in vitro pakking av fagmider.

Hva er likhetene mellom kosmid og phagemid?

• Både Cosmid og Phagemid er kloningsvektorer som brukes i rekombinant DNA-teknologi.
• Cosmid og Phagemid kan replikere enkeltstrenget og dobbeltstrenget DNA.
• Begge kan gjennomgå uavhengig replikasjon lik plasmider.
• Cosmid og phagemid kan gjennomgå in vitro emballasje og infisere bakterielle celler.
• Både Cosmid og Phagemid krever en egnet opprinnelse til replikering for kloning.

Hva er forskjellen mellom kosmid og phagemid?

Cosmid vs Phagemid
Cosmid er en hybridvektor som inneholder et cos-sted og et plasmid.	Phagemid er et plasmid som inneholder en F1 opprinnelse av replikasjon av F1-fagen.
Tilstedeværelse av Cos Sites
Cos-steder er tilstede i kosmid og er nødvendige for in vitro-emballasje.	Cos-steder er fraværende i fagemid.
Tilstedeværelse av F1 Opprinnelse til replikasjon
I kosmid kan fi-opprinnelse til replikering være eller ikke presentere.	F1 opprinnelse til replikasjon er tilstede i fagemid.
Tilstedeværelse av antibiotikaresistente gener
Antibiotikaresistente gener er tilstede i kosmider for å identifisere transformantene fra ikke-transformanter.	Antibiotikaresistente gener er fraværende i fagmider.
Krav til In Vitro Packaging
Krever et cos-sted.	Krever en sex pilus.

Sammendrag - Cosmid vs fagmid

Cosmid og Phagemid er kloningsvektorer som brukes i rekombinant DNA-teknologi. Kosmider er hybridvektorer som inneholder spesielle klebrige ender kjent som cos-steder. in-vitro Emballasje krever disse cos-stedene. Mens fagmider er plasmider som inneholder en f1 opprinnelse av replikasjon ekstrahert fra f1-fag. Både kosmid og fagemid kan gjennomgå uavhengig replikasjon eller in vitro emballasje til bakterielle celler. Dette er de viktige forskjellene mellom kosmid og fagemid.

Henvisning:

1.Qi, H, et al. "Fagemidvektorer for Phage Display: Egenskaper, egenskaper og konstruksjon." Journal of Molecular Biology., U.S. National Library of Medicine, 30. mars 2012. Tilgjengelig her 
2.Collins, J og B Hohn. "Cosmids: en type plasmidgenkloningsvektor som kan pakkes inn i Vitro i bakteriophage lambda-hoder." Fremgangsmåter ved det amerikanske vitenskapsakademi i USA, U.S. National Library of Medicine, september 1978. Tilgjengelig her  

Bilde Courtesy:

1.'Cosmid (engelsk) 'Av Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia