Forskjellen mellom oppstrøms og nedstrøms DNA
Share
Nøkkelforskjell - Upstream vs Downstream DNA
Det er viktig å ha generell kunnskap om DNAs sammensetning og struktur for å forstå forskjellen mellom oppstrøms og nedstrøms DNA. DNA er sammensatt av polynukleotidkjeder. Nukleotider er byggeblokkene som lager polynukleotidkjeder, og hvert nukleotid er laget av tre komponenter: et fem-karbon-sukker, en nitrogenbasert base og en fosfatgruppe. En fosfatgruppe og en OH-gruppe er bundet til henholdsvis 5'-stilling-karbon og 3'-stilling-karbon av sukkermolekylet i henholdsvis et nukleotid. Nukleotider knyttes sammen av fosfodiesterbindinger dannet mellom 5'-fosfatgruppe av en nukleotid og 3'-OH-gruppe av det tilstøtende nukleotid. Hvis en polynukleotidkjede har en fri 5'-fosfatgruppe, tilordnes den som 5'-enden; hvis den har en fri 3'-OH-gruppe, blir den tildelt som en 3'-ende. Derfor har DNA-strengene vanligvis 5'- og 3'-ender i henhold til endeposisjonene til polynukleotidkjedene. DNA eksisterer også som dobbelstrenget form. To tråder er antiparallelle mot hverandre. Derfor har DNA to tråder som løper mot 5 'til 3' retning og 3 'til 5' retning. Oppstrøms og nedstrøms DNA refereres med henvisning til transkripsjon og syntese av 5'-3'-mRNA-streng. Hvis DNA vurderes mot 5-enden av kodingsstrengen fra transkripsjonsinitieringsstedet, er det kjent som oppstrøms DNA. Hvis DNA vurderes mot 3'-enden fra kodingsstrengen fra transkripsjonsinitieringsstedet, er kjent som nedstrøms DNA. Dette er nøkkelforskjellen mellom oppstrøms og nedstrøms DNA.
INNHOLD
1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er Upstream DNA
3. Hva er Downstream DNA
4. Side ved side sammenligning - oppstrøms vs nedstrøms DNA
5. Sammendrag
Hva er Upstream DNA?
Et gen er en strukturell og funksjonell enhet arvelighet som ligger på DNA av en organisme. Det lagres med instruksjoner for å konstruere et protein. Genet har en spesifikk region av et DNA-molekyl. Når det trengs, transkriberer og translaterer det til et protein via syntese av en mRNA-streng. Normalt går en kodende streng av genet fra 5 'til 3' retning. Når den transkriberes, produserer den en mRNA-streng i samme retning 5 'til 3'. Under transkripsjonen serveres 3 'til 5' antisensstreng som malstrengen og initierer mRNA-syntesen. Det er et transkripsjonsstartsted i genet. Med henvisning til transkripsjonsinitieringsstedet er DNA-regionen mot 5'-enden av kodingsstrengen kjent som oppstrøms DNA. En promotor av genet ligger normalt i oppstrømsområdet av DNA. I eukaryotiske gener er det TATA-bokser, proksimale proksimale elementer og forsterkere i området oppstrøms for genet. Oppstrømsregionen av genet er referert til med negative tall. Oppstrøms DNA av et gen er av største betydning for transkripsjonen.
Hva er Downstream DNA?
Transkripsjonsstartsted er kjent som +1 punkt av et gen. DNA-regionen fra +1 peker mot 3'-enden av kodingsstrengen er kjent som nedstrøms DNA. Med andre ord er nedstrøms for genet fra transkripsjonsinitieringsstedet mot 5'-enden av malstrengen. Derfor inneholder nedstrøms DNA i et genområde transkripsjonsenhet og andre sekvenser, slik som terminatorsekvens. Promotoren kan påvirke den nedstrøms sekvensen av et gen. Nedstrømsdelen av et gen er referert til med positive tall. Nedstrøms DNA av et gen er den faktiske regionen som gir proteinproduktet.
Figur 01: Oppstrøms og nedstrøms DNA
Hva er forskjellen mellom Upstream og Downstream DNA?
Upstream vs Downstream DNA | |
| DNA-regionen mot 5'-enden av den kodende sekvens fra transkripsjonsinitieringsstedet er kjent som oppstrøms DNA. | DNA-regionen mot 3'-enden av kodingsstrengen fra transkripsjonsinitieringsstedet er kjent som nedstrøms DNA. |
| Elements | |
| Promotere og forsterkere er lokalisert på oppstrøms DNA | Transskripsjonsenhet og terminatorsekvensene er lokalisert i nedstrøms DNA. |
| nummerering | |
| Nukleotider i oppstrømsområdet refereres med negative tall | Nukleotider refereres med positive tall. |
| Funksjon | |
| Denne regionen inneholder elementer som er nødvendige for å regulere og initiere transkripsjon | Denne regionen inneholder instruksjon for å produsere et protein og avslutte transkripsjonen |
Sammendrag - Upstream vs Downstream DNA
Det er lett å identifisere oppstrøms og nedstrøms for en RNA-streng. Med hensyn til referansesettet er regionen mot 5'-enden av RNA-strengen kjent som oppstrøms-RNA mens regionen mot 3'-enden er kjent som nedstrøms RNA. I DNA er det imidlertid to tråder som løper i begge retninger 5 'til 3' og 3 'til 5'. Derfor er forskjellen mellom oppstrøms og nedstrøms DNA komplisert. Derfor er det differensiert med henvisning til transkripsjon av et gen. Fra transkripsjonsinitieringsstedet mot 5-enden av følelsesstrengen er DNA-regionen kjent som oppstrøms DNA, mens fra transkripsjonsinitieringsstedet mot 3'-enden av følelsesstrengen er kjent som nedstrøms DNA. Dette er forskjellen mellom oppstrøms og nedstrøms DNA.
referanser:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi og Jonatha M. Gott. "Spesifikke roller for sekvenser oppstrøms og nedstrøms fra Physarumediting-steder." RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, september 2009. Web. 18. mars 2017
Bilde Courtesy:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro og Luísa Romão. "Gene Expression Regulation ved Upstream Open Reading Frames og Human Disease." PLOS Genetics. Public Library of Science, n.d. Web. 18. mars 2017.
