Forskjellen mellom målrettet og ikke-målrettet proteomik

Hovedforskjellen mellom målrettet og ikke-målrettet proteomikk er at målrettede proteomics tar sikte på å måle overflaten av et spesifikt protein mens ikke-målrettet proteomikk ikke målretter mot et bestemt protein.

Proteomics er den omfattende studien av proteiner, deres strukturer og funksjoner. Den studerer hele proteinkomplementet i en celle, vev eller en organisme under spesielle forhold. Det er to typer proteomics som målrettede proteomics og ikke-målrettede proteomics.

INNHOLD

1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er målrettet proteomik
3. Hva er ikke-målrettet proteomik
4. Likheter mellom målrettet og ikke-målrettet proteomik
5. Sammenligning ved siden av siden - Målrettet mot ikke-målrettet proteomik i tabellform
6. Sammendrag

Hva er målrettet proteomik?

Som navnet antyder, målretter proteomikum et bestemt protein eller et peptid i en kompleks blanding av proteiner for analyse. Deretter analyserer den tilstedeværelsen og mengden av det forhåndsvalgte bestemte protein. Denne metoden er mulig for bare én prøve eller på tvers av flere prøver. Denne metoden er egnet selv for en bestemt gruppe proteiner. Det resulterer i mer presise, kvantitative og sensitive data. Videre produserer massespektrometri kombinert med målrettede proteomikker mer nøyaktige pålitelige målinger. Denne metoden bruker triple quadrupole massespektrometer (QQQ) for analyse.

Figur 01: Proteomics

Målrettet proteomikk er en egnet metode hvis du vil verifisere om et knockdown-mål faktisk slås ned eller når du vil kvantifisere et bestemt protein / peptid i blodserum, cerebral væske eller i cellelysat etc. Du kan også bruke det hvis du vil for å kontrollere om et bestemt protein er differensielt uttrykt over prøver eller i løpet av et tidsforløpseksperiment.

Hva er ikke-målrettet proteomik?

Uriktet proteomikk, som navnet nevner, målretter ikke mot et bestemt protein eller peptid for dets analyse. Discovery proteomics er et annet navn for ikke-målrettet proteomikk. Faktisk er det en mer "global" analyse. Generelt utfører ikke-målrettet proteomikk å svare på spørsmålet "hvilket protein eller proteiner er i denne prøven eller flere prøver?". Denne metoden er ikke følsom som målrettet proteomikk. Men det kan identifisere og måle mange proteiner, inkludert nye proteiner. Uriktet proteomikk kan produsere både kvantitative og kvalitative målinger.

Hva er likhetene mellom målrettet og ikke-målrettet proteomik?

• Både målrettede og ikke-målrettede proteomikker måler proteiner i prøver.
• De er viktige i proteinanalyse.
• Disse metodene bruker massespektrometri.

Hva er forskjellen mellom målrettet og ikke-målrettet proteomik?

For det første er målrettet proteomikk bestemmelse av tilstedeværelsen og mengden av et bestemt protein eller peptid i kompleks blanding av proteiner. I kontrast er ikke-målrettet proteomikk den kvantitative og kvalitative studien av proteiner tilstede i en prøve eller prøver uten å målrette mot et bestemt protein. Målrettet proteomikk utføres med forhåndsvalgte eller målrettede proteiner, mens uriktet proteomikk utføres for å finne ut hvilke typer proteiner i denne prøven. Videre er målrettet proteomikk mer følsom enn ikke-målrettede proteomika.

Sammendrag - Målrettet mot ikke-målrettet proteomik

For å oppsummere er målrettede og ikke-målrettede proteomikker to typer proteinstudier. Som navnet tilsier, målretter proteomikene et bestemt protein, mens ikke-målrettede proteomikker ikke målretter mot et bestemt protein. Dette er forskjellen mellom målrettet og ikke-målrettet proteomikk.

Henvisning:

1. "Targeted Proteomics." UC Davis Proteomics Core, Tilgjengelig her.
2. "Proteomics / Introduction to Proteomics." Musikk teori / moduser - Wikibooks, åpne bøker for en åpen verden, Tilgjengelig her.

Bilde Courtesy:

1. "Proteomics" Av Xxl7441 på engelskboksen - Overført fra en.wikibooks til Commons (Public Domain) via Commons Wikimedia