Forskjellen mellom motiv og domene

De nøkkelforskjell mellom motiv og domene er at motivet er ikke uavhengig stabilt mens domenet er uavhengig stabilt.

Proteiner er viktige biologiske makromolekyler som finnes i kroppen vår. På den annen side vil genetisk kode for et gen bestemme aminosyresekvensen til et protein. Videre har proteiner primære, sekundære og tertiære strukturer. Den primære strukturen er aminosyresekvensen av polypeptidkjeden. Når polypeptidkjeder bretter seg sammen, danner det den sekundære strukturen av proteinet. Alfa-helikser, betongark og sekundærstrukturer tilhører sekundære strukturer. Visse grupperinger av super sekundære elementer er kjent som proteinmotiver. Den tertiære strukturen av et protein refererer til sin tredimensjonale struktur som bestemmer proteinets funksjon. Domenet er en foldet del av et proteinmolekyl, som er kuleformet og har en diskret funksjon. Det er den grunnleggende funksjonelle og tredimensjonale strukturen av proteinet.

INNHOLD

1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er Motif
3. Hva er Domain
4. Likheter mellom motiv og domene
5. Side ved side-sammenligning - Motiv vs Domene i tabellform
6. Sammendrag

Hva er Motif?

Motiv er en viss gruppering av super sekundære elementer av proteiner som alfa helices og beta strukturer. De er noen slags mønstre som finnes i forskjellige proteiner. Motiver beskriver foldemønstrene til sekundære strukturelementer og deres interaksjoner. Disse foldemønstre stabiliseres ved lignende sammenhenger som er tilstede i tertiære strukturer. Imidlertid er de ikke så komplekse som tertiære strukturer.

Figur 01: Motiv

De er enkle kombinasjoner av sekundære strukturer av proteiner. Motivet er ikke stabilt av seg selv. Videre forklarer motivene strukturen til et protein, men forutsi ikke funksjonen av et protein. Eksempler på proteinmotiv er et beta-alfa-beta-motiv, gresk nøkkelmotiv, Beta-fat, Beta-meander-motiv, osv..

Hva er Domain?

Domenet er en grunnleggende, funksjonell og tredimensjonal enhet av et protein. Den utfører en bestemt funksjon. Et enkelt protein kan ha flere forskjellige domener. Hvert domenenavn er en uavhengig enhet. Det er en globulær struktur. Det er ansvarlig for en bestemt funksjon eller samhandling. Domener kan brukes til å hypotesere funksjonen til et ukarakterisert protein. Når man analyserer et protein, er det viktig å ta hensyn til siden domener er proteinets funksjonelle enheter.

Figur 02: Tre forskjellige domener av pyruvat kinase

Domener er svært stabile og kompakte strukturer. De kan enkelt skilles fra andre regioner. Pyruvatkinase har tre skilleområder som vist i figur 02. Lengden på domenet kan variere, og gjennomsnittlig lengde er 100 aminosyrer. Hvert domen inneholder en hydrofob kjerne bygget fra sekundære strukturelle enheter. Flere domener krever samlet tertiær struktur av et protein.

Hva er likhetene mellom motiv og domene?

• Motiv og domene er enheter som er til stede i proteinmolekylene selv.
• De er nyttige når du klassifiserer proteinfamilier.

Hva er forskjellen mellom motiv og domene?

Motiv er en viss gruppering av super sekundære elementer av proteiner som alfa helices og beta strukturer mens domenet er den funksjonelle enheten av et protein. Videre er motivet en sekundær struktur, mens domenet er ansvarlig for proteinets tertiære struktur. Videre er domenet en uavhengig enhet, i motsetning til et motiv. Domenet skildrer også funksjonen til et protein mens motivet ikke er. Dette er de viktigste forskjellene mellom motiv og domene. Infografisk under viser forskjellen mellom motiv og domene i tabellform.

Sammendrag - Motiv vs Domene

Motiv er et arrangement av sekundære strukturer av proteinmolekylet. Det er ikke vanligvis stabilt av seg selv, i motsetning til et domene. Domenet er en uavhengig stabil struktur av et protein. Derfor kan det være et del- eller hele proteinmolekyl. Det er en tredimensjonal grunnleggende funksjonell enhet av proteinet. Dessuten har den en funksjon, og det er en selvstendig enhet. Motivet kan være en del av domenet. Men domenet kan ikke være en del av et motiv. Dette er forskjellen mellom motiv og domene.

Henvisning:

1. "Protein Domain." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31. juli 2018. Tilgjengelig her

Bilde Courtesy:

1. "Antraks-toksinproteinnøkkelmotiv" Av NatelewisDivivative arbeid (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Pyruvate kinase protein domener" Av Thomas Splettstoesser - Eget arbeid, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia