Omvendt transkripsjons-polymerasekjedereaksjon (RT-PCR)
Fremskritt innen bioteknologi har resultert i oppdagelsen av flere måter å håndtere kravene til organtransplantasjoner gjennom årene. Først kunne en person som frivillig donerer et organ umiddelbart etter døden til en pasient i nød, bare kunne starte operasjonen for transplantasjoner. Biologers kontinuerlige studier og forskning fører til oppdagelsen av stamceller.
Stamceller refererer til de som er tatt fra DNA fra et embryo, som vil tjene som kilde til regenerering av celler som i utgangspunktet ville være en klon av orgelet hvor DNAet er hentet. Mens menneskerettighetsaktivister lobbyer for å stoppe slike prosedyrer, har vellykkede operasjoner faktisk bevist effektiviteten av stamcelleutviklingen i organtransplantasjoner.
Før man kan sette pris på og forstå forstås stamceller, er det imidlertid et behov for å bli kjent med de forskjellige terminologiene knyttet til denne vitenskapelige funn. Stamcelle dyrking omhandler DNA og dets koding. Det er derfor viktig for studenter eller personer som er interessert i feltet å skille mellom RT-PCR og qPCR.
Omvendt transkripsjons-polymerasekjedereaksjon (RT-PCR) er en av de mange varianter av polymerasekjedereaksjonen eller PCR. Denne laboratorieteknikken er mye brukt i molekylærbiologi for at forskerne skal produsere flere kopier av en bestemt DNA-sekvens gjennom en prosess som er uttalt som "amplifisering." Forskjellen mellom RT-PCR og tradisjonell PCR er at RNA først transkriberes i omvendt dets DNA-komplement, som benytter revers transkriptase. Det nye komplementære DNA som inneholder reversert transkripsjon vil da bli amplifisert ved bruk av den tradisjonelle PCR eller sanntids-PCR.
De fleste elever som studerer denne prosessen, gjør ofte feilen ved å bytte omvendt transkripsjons-PCR og sanntids-PCR som de to forkortes tilsvarende. For å unngå forvirring merker biologene sanntids-PCR som kvantitativ sanntids-PCR eller qPCR.
QPCR skiller seg sterkt fra RT-PCR, da qPCR er ansvarlig for måling av forsterkning som det oppstår. Det kan sies at RT-PCR starter forsterkningsprosessen, mens qPCR måler det som prosedyren finner sted.
Kvantitativ sanntids-PCR
QPCR har faktisk revolusjonert den tradisjonelle enveis-tilnærmingsmetoden når det gjelder kvantifisering av DNA og RNA, da bruk av qPCR-metoden gjør det mulig for biologer å bestemme den initiale konsentrasjonen av kjerne-syren selv før reaksjonsresultatene er observert og nedskåret.
Anvendelsen av qPCR, som nå anses som den mest kraftige og sensitive analyseteknikken for genetiske studier, har utvidet seg betydelig. Det er for tiden involvert i kvantitativ genekspresjonsanalyse, genotyping, patogen deteksjon og analyse av SNP, sammen med RNA interferensmålinger.
QPCR kombineres ofte med prosessen med revers transkripsjon for å kvantifisere messenger RNA og MicroRNA tilstede i cellene av vev observert og eksperimentert med. Dette gir da en annen synlig forskjell mellom de to: RT-PCR kan brukes til amplifikasjonsprosessen, men det må fusjoneres med qPCR for kvantifiseringsformål.
QPCR er også kjent for å være mer kvantitativt da dataene kan samles inn som den eksponensielle vekst (log) -fasen av PCR utvikles. Biologer merker at mengden av biproduktet av PCR er direkte proporsjonalt med mengden av nukleinsyre som vil bli målt gjennom qPCR.
På den annen side er RT-PCR langt fra å ha en kvantitativ natur, da overholdelse av intensiteten av det amplifiserte båndet på en gel etter settet av en konsentrasjonsstandard kan føre til at den har "halvkvantitativ" innledning.
1.QPCR og RT-PCR er begge termer brukt i bioteknologi og benyttet til produksjon av flere kopier av DNA.
2.RT-PCR brukes til å amplifisere reversert transkripsjon av DNA-koden; QPCR måler forsterkningen.
3.RT-PCR er for amplifisering, mens qPCR er for kvantifisering.
4.QPCR er kvantitativ i naturen, mens RT-PCR ikke er.