De tre indiske medisinske systemene er "Siddha, Ayurveda og Unani. Siddha medisinsk system er hovedsakelig praktisert i den sørlige indiske staten Tamil Nadu. Men noen utøvere sier at det er en nordindisk skole av Siddha medisin også som utviklet seg i Himalaya. Siddha var populær i det gamle India og antas å være den eldste medisinske systemet i verden. Systemet ble utviklet av "Siddhars" som skulle være hellige med åndelige krefter i det gamle India. De hadde fått kunnskapen fra hinduisk gud Lord Shiva og hinduistisk gudinne Lord Shiva og Goddess Parvathi.
Indiske skrifter sier at det var 18 viktigste "Siddhars", og av dem var Agasthiyar far til Siddha Medicinal System. Siddha-systemet er basert på forutsetningen om at bare en sunn kropp kan bidra til å utvikle en sunn sjel, slik at gamle utøvere regulerte sitt liv med intense yogiske øvelser, faste, meditasjon og oppnådde supermakter, inkludert miraklet til å kurere sykdom. Siddha medisin "hemmeligheter" ble skrevet på palmblad manuskripter som systemet utviklet som det praktiseres i dag i India.
Ayurveda, derimot, er relatert til Vediske perioden i India, og dens tradisjonelle medisinske hemmeligheter ble funnet i Sushruta Samhita og Charaka Samhita. Utøvere mener at ayurveda kombinerer kunnskapen som finnes i de fire vedaene, og forebygging av sykdom er viktigere med riktig tilpasning av ens livsstil til årstidene.
Både Siddha og Ayurveda innser at sykdommen er forårsaket av ubalansen i de tre humørene. Men Siddha ser overhodet av humør som vatham, pitham og kapam i barndom, voksen alder og alderdom, mens ayurveda ser kapamens dominans i barndommen, vatham i alderdommen og pitham i voksen alder!.
Ayurveda fokuserer på fem elementer av jord, vann, brann, luft og eter som påvirker blodet, chyle, kjøtt, rask, beinmarg og sæd. Ayurveda tilskriver også opplevelser av menneskeliv som 20 "gunas" eller kvaliteter. Den bruker kirurgi, yoga, meditasjon og massasje teknikker. Siddha fokuserer på syv elementer saram (plasma) for vekst, cheneer (blod) for næring av muskler, ooun (muskel) for kroppsform, kollzuppu (fettvev) for oljebalanse og smøring av ledd, enbu (bein) for kroppsstilling, moolai (nerve) for styrke og sukila (sæd) for reproduksjon.