Forskjellen mellom transposon og retrotransposon

Transposon vs Retrotransposon

Transposons og retrotransposons er genetiske komponenter av DNA, og det er store forskjeller mellom dem. Prosentandelen tilstedeværelse av disse genetiske materialene varierer mellom arter, og deres funksjoner bestemmer organismens skjebne med mutasjoner og andre fenotypisk viktige endringer. Transposons og retrotransposons er gener eller samlinger av bestemte gener som er lokalisert i DNA-strengene, og endringer i deres steder har vært hovedårsakene til disse konsekvensene. Imidlertid har denne artikkelen til hensikt å diskutere funksjonene til disse genene kort og presenterer en sammenligning mellom transposoner og retrotransposoner.

Hva er Transposon?

Transposoner er interessante fragmenter eller segmenter av DNA med evnen til å endre plasseringen av DNA-strengen i form av kutt og limmekanisme. På grunn av denne mobile naturen av transposonene, er disse kjent som hoppende gener. Transposons er av to hovedtyper kjent som klasse I transposons og klasse II transposons. Vanligvis blir klasse II-typen referert som transposonene, og type I-typen refereres til som retrotransposons. Prosessene for kutting og liming av mobile DNA-segmenter er regulert av enzymetransposase. Enzymet binder seg til begge endene av transposonet og kutter DNA-strengens fosfodiesterbindinger, isolerer transposonet, flytter det til målstedet og binder seg til det nye stedet. Imidlertid er denne prosessen interessant å forstå, da enkelte transposoner bare kan bevege seg til bestemte steder bare på grunn av inkompatibiliteten til basis-sekvenser med målområdet. Gener med den ene enden av en enkelt streng har samme basesekvens med den andre enden av den andre enkeltstrengen er transposoner med klistrede kanter, fordi de kan binde til målene i mål-DNA-strengen med den samme basesekvens som i de klistrede endene . Imidlertid kan denne mobiliteten av gener forårsake forandringer av genotypen såvel som i fenotypen av organismen. Forskere oppfunnet om transposons og genetisk modifisert mat og organismer i henhold til de foretrukne tilpasninger ble da gjort tilgjengelig. Meget produktive landbruksavlinger, antibiotika med medisinske egenskaper, husdyr var noen av de fordelaktig utviklede produktene etter oppfinnelsen av transposoner av Barbara McClintock i 1940-tallet.

Hva er Retrotransposon?

Retrotransposoner er klasse I transposonene, og disse beveger seg gjennom genomet ved hjelp av kopimekanismen. Mekanismen for mobilitet av retrotransposoner involverer få hovedtrinn som kopiering av gensegmentet av DNA-strengen inn i RNA, overføring av kopien av RNA til målstedet, transkripsjon av RNA-sekvensen tilbake til DNA ved bruk av revers transkriptase og innføring av genet til den nye plasseringen av DNA-streng av genom. De to ender av disse retrotransposons har vanligvis lange terminale gjentakelser med ca. 1000 basepar, og de brukes som identifikasjonsegenskaper av disse gener. Disse generene blir lett forsterket inne i genomet, og prosentandelen av retrotransposonene i det humane genom er ca. 50%. Disse kan være ganske farlige fordi det forårsaker viruset av AIDS, HIV og T-celle leukemivirus har retrotransposons i deres RNA-genomer. Faktisk kan disse virusene binde retrotransposonsene til et hvilket som helst sted av de humane DNA-strengene ved bruk av revers transkriptase og integrase. Integrasenzymet fungerer på samme måte som transposase i klasse II transposoner.